カイ二乗検定のサンプル数計算の解説
カイ２乗検定のサンプルサイズ計算を EZR で行うには？
カイ２乗検定のサンプルサイズと言っても、準備するのは２群の割合だ。
２ｘ２分割表から２群のそれぞれの割合を計算しておく。
あとは、２群を１：１にするのか、有意水準５％、検出力８０％、両側検定でよいかどうかを決めておく。
普通は上記の条件でOK。
EZRの標準でもある。
実際の計算は、統計解析→必要サンプルサイズの計算→２群の比率の比較のためのサンプルサイズの計算と進む。
第１群が５０％、第２群が７５％の場合は、以下のように入力する。
あとは特に変更せずOKをクリックすると計算される。
１群６６例必要と計算された。
ちなみに、カイ２乗検定の連続性補正をしないとすると、下記にリンク先を掲示している統計ソフトRで計算される１群５８例と一致する。
連続性補正をする、EZR標準のほうが、確実に統計学的有意を検出できる点で、適切と思う。
カイ２乗検定のサンプルサイズ計算を R で行うには？
こちらを参照のこと。
どうしても、カイ二乗検定のサンプルサイズを行いたい場合は、以下の記事も参照のこと。
カイ２乗検定のサンプルサイズ計算を SPSS で行うには？
SPSSで行うには、分析→検定力分析→比率→独立サンプルによる２項検定 を選択する。
上記と同じ条件であれば、以下の赤枠のように入力する。
１群６６例必要と計算される。
EZRと同じ結果になる。
Fisherの正確検定を選んでも必要サンプルサイズは同じである。
カイ２乗検定のサンプルサイズ計算を G*Power で行うには？
カイ二乗検定のサンプルサイズ計算を G*Power で行うには、以下のように設定する。
まず、z tests を選び、Proportions を選ぶ。
Two tail（両側検定）、 第 1 群の割合、第 2 群の割合、有意水準 α、検出力 Power、群間の比を設定する。
Option をクリックして、連続性の補正（Use continuity correction）にチェックを入れる。
OK で戻って、右下の Calculate をクリックすると計算される。
1 例ずれの各群 65 例と計算されたが、EZR や SPSS とほぼ同じ結果と言える。
カイ２乗検定のサンプルサイズ計算をエクセルで行うには？
よければこちらをどうぞ。
割合の差の検定（割り付け比にも対応）サンプルサイズ計算【エクセルでサンプルサイズ】 | TKER SHOP
まとめ
２値のカテゴリカルデータの２群を比較するときに使うカイ２乗検定のためのサンプルサイズ計算を紹介した。
実際は、２群の割合を予想して、その値を用いて計算する。
２群の割合以外は、有意水準５％、検出力８０％、１：１の比、両側検定、カイ２乗検定連続性補正ありという設定で計算するのが良いだろう。
データ解析のときには、カイ２乗検定連続性補正ありでもFisher正確検定でもどちらで検定してもかまわない。
参考書籍
EZR 公式マニュアル
SPSS 医療系データ解析の定本
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