クラスタリング– category –

「k-means法の使い方は分かったのですが、クラスタ数（k）をいくつに設定すればいいのか分からず、とりあえず3にしています……」 k-means法を学び始めたばかりの人から、こういう相談をよく受ける。関数の使い方自体は簡単なのに、肝心の「kをいくつにする...

前回の記事では、量的変数と質的変数が混在する患者データに対してFAMDで次元を縮約し、その主成分に対してHCPC（Hierarchical Clustering on Principal Components）で臨床表現型を同定するところまでを解説した。 「先生！HCPC(res_famd, nb.clust = -1)...

階層的クラスター分析のクラスター化の方法のウォード法とはどういう方法なのか？ クラスター化とは？ 階層的クラスター分析はクラスター化をしていく。 クラスター化とは何か？ 階層的クラスター分析では、最初にJaccard係数等の指標で、単語同士の「距離...

R で階層的クラスタリングを行う方法。 階層的クラスタリングとは さまざまな特徴を持った集団、たとえば米国50州を、特徴が似ている似ていないで近い・遠いを表現して部分集団（クラスター）に分けることを言う。 以下も参照のこと。 階層的クラスタリン...

二次元でユークリッド距離を図示してみた。 二次元のユークリッド距離を示すサンプルデータ 二次元でユークリッド距離を例示してみるためのサンプルデータは、R に組み込まれているUSArrestsというデータを使う。 USArrestsの1列目 Murderと2列目 Assault...

ユークリッドは紀元前325年に生まれたギリシャの数学者。 著した著書は数学のなかでも特に幾何学の教科書として有名であった。 ユークリッドが考え出した「距離」とは？ ユークリッド距離とは？ ユークリッド距離は、幾何学で扱う事項である。 幾何学とは...

クラスター分析とは何か？ そもそも、クラスターって何？ クラスターとは？ クラスターとは、グループとか塊（かたまり）の意味。 データをいくつかの塊に分けたものをクラスタと言う。 クラスター分析とは？ 集めたデータをいくつかの塊に分けて、その特...