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バギングというアンサンブル学習を R でやってみる。 ランダムフォレストとバギングの違い ランダムフォレストとバギングの違いは、以下の記事を参照。 バギングのための R パッケージの準備 adabagパッケージをインストールする。 install.packages("adab...

決定木分析をRで行う方法を紹介。 難しいプログラムが組めなくてもすぐに使える。 決定木分析のRパッケージの準備 決定木分析のパッケージrpartときれいな決定木の描画パッケージpartykitをインストールする。 インストールは初めの一回だけでOK。 install...

機械学習で、よりよく推測できるモデルを選ぶ。 統計ソフトRのISLRパッケージのWeeklyデータで基礎的な機械学習を行ってみた。 Rで機械学習を行うためデータの準備 ISLRパッケージのWeeklyデータは、S&P500指数の週当たりのリターンのデータ。 9つの変...

R の ISLR パッケージの Auto データセットを使った分析例。 データの準備 最初の一回だけ、ISLRパッケージをインストール。 install.packages("ISLR") ISLRパッケージを呼び出して、解析開始。 library(ISLR) ISLRパッケージのAutoデータセットを用いて解...

有害必要数（Number Needed to Harm, NNH）は、1人の有害事象が起こる人が出現するのに、何かの影響を受けた人が何人必要かという数。 NNHを計算するにはどうやるか？ 使えるシチュエーションは、 曝露Aを受ける人受けない人 処置Bを受ける人受けない人 介...

罹患率比の計算は、どうやるのか？ R での計算の方法。 罹患・罹患率・罹患率比とは？ 罹患（りかん）とは？ 罹患とは病気にかかること。 病気にかかったことは、診断によってわかる場合と、発症によってわかる場合がある。 診断とは、外来の診察で下され...

Rを使って、 多重ロジスティック回帰分析でBICを使って、 簡単に変数選択ができる。 変数選択の関数の前に BIC とは BICは、 Bayesian Information Criterionの頭文字語。 統計モデルへのあてはまりを検討するときに、 変数が多すぎると評価が下がる規準に...

R で重回帰分析を行った際の変数選択の方法の解説。 bestglmの準備とサンプルデータ R の bestglm() 関数は、AIC, BIC(デフォルト), BICqなどの Information Criterion 情報規準を使って ベストの変数の組み合わせを見つけてくれる。 bestglmパッケージのz...

R で箱ひげ図を描くにはどうしたらいいか？ R で箱ひげ図を書く関数 R で箱ひげ図を書く関数は、boxplot() 第 1 四分位から第 3 四分位までの箱を描き、その中にある中央値に線を引く。 第 1 四分位と第 3 四分位の差（四分位範囲）の 1.5 倍の線（ひげ）...

ログランク検定のサンプルサイズ計算を R で行う方法 ログランク検定はどうやるか？ ログランク検定は、時間経過とともにイベントが起きていくデータの群間比較をする方法。 患者さんの死亡をイベントとしたデータ、病気が再発することをイベントとしたデ...