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エクセルでデータ分析をしたいが、データ分析というボタンが見つからない エクセルで、データ分析がない場合の対処法 エクセルでデータ分析がない場合はファイルから まず、ファイルをクリック 次に、オプション（一番左下）をクリック アドイン → 分析ツ...

カイ二乗検定をわかりやすく解説。 エクセルでの計算方法も紹介。 カイ二乗検定とは？ カイ二乗検定とは、サンプルのグループ間の「何か」の割合を比較することで、グループの母集団の割合が統計学的に違うかどうかを調べる方法である。 グループ間で何か...

相関係数の比較はどうやるか？ 相関係数の差の検定とは？ 相関係数の比較　相関係数の差の検定 （この記事で言う相関係数は、すべてPearsonの積率相関係数を指している） 相関係数の差の検定は、以下の検定統計量 T を計算し、標準正規分布で有意確率を求...

カイ二乗検定に必要なサンプル数計算の解説 カイ２乗検定のサンプルサイズ計算を EZR で行うには？ カイ２乗検定のサンプルサイズと言っても、準備するのは２群の割合だ。 ２ｘ２分割表から２群のそれぞれの割合を計算しておく。 あとは、２群を１：１にす...

EZRの出力は固定長といってスペースできれいに整えられている。 Excelのテキストファイルウィザードを使用すればきれいに貼り付けることができる。 EZRの出力をエクセルにきれいに貼り付ける方法 EZRを機能を使ってきれいに出力する方法は下記のブログ記事...

EZRの出力をきれいにエクセルに貼り付ける方法があるか？ エクセルで開けるファイルに出力する方法があるか？ EZRの出力結果をきれいにエクセルに貼り付ける方法 EZRで分割表の出力結果をエクセルに貼り付ける方法を紹介する。 まずEZRで分割表を計算する...

相関係数の計算に必要なサンプル数はいくつか？ 相関係数の検定との関係から紹介。 相関係数のサンプル数計算の前提となる検定の計算方法 相関係数の検定は、母集団の相関係数、母相関係数（ぼそうかんけいすう）がゼロかどうかの検定である。 通常はｔ分...

割合の差の検定のサンプルサイズ計算を R で行う方法、エクセルで行う方法 割合の差の検定のサンプルサイズ計算 R の関数を使って 統計ソフトRには、power.prop.test()という関数が用意されていて、簡単に計算できる。 第1群が50%(0.5)、第2群が75%(0.75)...

正規分布近似を用いた信頼区間とClopper-Pearson 信頼区間を計算する方法。 割合の区間推定（正規分布近似を用いた簡易的な方法） 割合の分散は、割合をp、サンプルサイズをnとすると、 $$ \frac{p (1 - p)}{n} $$ で計算できる。 標準誤差はその平方根で...

多重比較のサンプルサイズ計算を R で行う方法 ボンフェローニ型 多重比較のサンプルサイズ計算 Bonferroni（ボンフェローニ）型多重比較とは、比較する数で有意水準を割って、割った有意水準より小さい有意確率の場合、統計学的有意と考える方法。 三群あ...

がん患者さんの生存期間中央値を5年生存率から逆算で求めるにはどうしたらよいか？ R で計算する方法。 5 年生存率から逆算で生存期間中央値を求める計算式 生存確率は、一般論として指数関数で近似できる。 実際には、がんの治療後すぐになくなったり、数...

点推定値が100%に近いとき、より適切に割合の信頼区間を計算する方法 Wilson's score method（ウィルソンのスコア法）の解説。 割合の信頼区間は近似を使っている 割合の信頼区間は以下の式で計算できる。 これは正規分布を近似的に使っている。 $$ \hat{p...

標本の大きさの求め方。エクセルを使う方法。 サンプルサイズ計算をエクセルで行う方法。 なかなか探しても見つからないサンプルサイズ計算がここでは見つかる！！ アンケート調査 アンケートは何人に取れば最適なのか？ エクセルファイルで簡単に計算でき...

ログランク検定のサンプルサイズ計算を R で行う方法 ログランク検定はどうやるか？ ログランク検定は、時間経過とともにイベントが起きていくデータの群間比較をする方法。 患者さんの死亡をイベントとしたデータ、病気が再発することをイベントとしたデ...

ICC(1,1) の計算とサンプルサイズ計算を R で行う方法 級内相関係数 ICC(1,1) の計算 級内相関係数（ICC）は、信頼性指標に使える。 ICC Case1は、一人の検査をする人（検者、けんじゃ）の一貫性を確認する指標だ。 ICC(1,1)は、一人の検者がk回測定を行っ...

トレンド検定のサンプルサイズ計算。 トレンド検定とは トレンドとは、順序カテゴリの小さいほうから大きいほうに移るにつれて、カテゴリの平均値や割合が大きくなるとか小さくなるとか、傾向や相関があることを指す。 トレンドがなく同じというのが帰無仮...

ダネット検定のサンプルサイズ計算を R で行う方法 ダネット検定サンプルサイズ計算スクリプトの前提 ダネット検定とは、コントロール群、統制群、非処理群などと呼ばれる比較対照グループと、複数用量の治療群、処理群を比較する検定である。 サンプルサ...

クロスオーバー試験のサンプルサイズ計算を R で行う方法 クロスオーバー試験とは クロスオーバー試験とは、二群どちらにも二つの介入を受けてもらう試験。 従来の薬と新薬とか、方法Aと方法Bとか、二つの方法を順番を変えて受けてもらう。 利点は、小さい...

非劣性試験のサンプルサイズ計算 生存時間データの場合 非劣性試験のサンプルサイズ計算 生存時間データの場合 例 1 各記号の意味は以下のとおり。 t：観察期間。 S1とS0：それぞれ治療群とコントロール群の生存率。 dF：Freedmanの方法による各群必要な死...

非劣性試験のエンドポイントが連続量で、各群の平均値を求める場合、サンプルサイズはどのように計算するか？ RとEZRで行う方法。 非劣性試験における非劣性検定とは？ 劣っていないことを積極的に証明する検定。 臨床的に意味のある差を設定して、それよ...

非劣性検定は劣っていないことを証明する検定。 割合の非劣性検定のサンプルサイズ計算はどうやるか？ 割合の非劣性検定のサンプルサイズ計算 各変数の意味は、以下のとおりとする。 pA：試験薬の有効率とする。 pB：標準薬の有効率とする。 pB.bar：帰無...

生存時間解析のサンプルサイズ計算の方法 Cox の比例ハザードモデルを使う前提の計算 生存時間解析のサンプルサイズ計算 その 1 R でスクリプトを書いてみた。 S0がコントロール、S1が治療群、それぞれの生存率。 dが、両群合わせて合計の死亡者数。 sampl...

マッチドケースコントロール研究のサンプルサイズ計算の方法 マッチドケースコントロール研究とは？ 年齢、性別、など、病気に深くかかわっている因子だけど、研究対象にしたいわけでないとき、影響をなくしてしまいたい。 ケースとコントロールの重要な因...

ケースコントロール研究のオッズ比を求めるためのサンプルサイズ計算はどうやるのか？ ケースコントロール研究のサンプルサイズ計算の前提 一般人の危険因子にさらされている割合をfとする。 想定されるオッズ比をRとする。 前提はこの二つだけだ。 この二...

分散分析のサンプルサイズ、サンプル数、n 数の計算を R でやってみた。 分散分析のサンプルサイズ計算（誤差分散がわかっている場合） 群の数をk、群間で最大の差（母平均の差の最大値）をd、誤差の母分散の平方根を sigma0 とする。 この場合の母分散は...

アンケート調査は何人にとったらいいか？ アンケート調査に必要なサンプル数の前にアンケート調査の目的 アンケート調査に必要なサンプルサイズを考える前に、アンケート調査では、何をどうしたいのか？ 「アンケート調査に必要なサンプル数」といった場合...

割合に関するサンプルサイズ計算の方法 推定精度と検定の 2 種類あり 推定精度に基づく方法 相対精度deltaで，割合を推定する際のサンプルサイズ計算は、以下のような R スクリプトで計算できる。 myPsize <- function(p,delta){ n <- 4*(1-p)/(p*de...

対応のある t 検定は、前後比較をするデザインの時に用いる。 対応のある t 検定のサンプルサイズ、サンプル数はどのくらいであればよいか？ 対応のある t 検定のサンプルサイズ計算に必要な数値 サンプルサイズ計算に必要なのは、 検出力 標準化された前...

t 検定のサンプル数計算の方法 t 検定のサンプル数計算（1:1の場合） R の power.t.test()を用いる。 必要な情報は、検出力をどうするかと、二群の平均値の差。 標準偏差で割った標準化された差が必要だ。 検出力は慣例で80%＝0.8が多い。 90%＝0.9もよく...

いままでの方法と比べて、格段にいいとか、際立っていいとか、じゃなくてもいい場合がある。 ダメじゃなければいい。 劣っていなければいい。 劣っていなければいいという検定方法が、非劣性（ひれっせい）検定だ。 じゃ、どういうときが劣っていないって...

メタアナリシスをしたい場合、統合する点推定値と標準誤差が必要になる。 曝露有り無しと疾患ありなしが生データとして入手できる場合は問題ないが、多変量調整のあとの点推定値と95%信頼区間しかない場合は多い。 点推定値＋95%信頼区間しか手に入らない...

平均70点、標準偏差15点のテストの場合、90点以上の学生は上位何パーセントに当たるか？ という問題に使うパーセンタイル percentile とクォンタイル quantile。 それぞれ百分位数と分位数ともいわれる。 パーセンタイルを求めるには？ pnorm()を使う。 母...

R で母比率（母集団における割合）の区間推定を行う方法。 母比率の信頼区間（Agresti & Coull の方法） sを、success 分子（該当数）とする。 nを、number  分母（サンプルサイズ）とする。 Functionは以下の通りだ。 bohiritu.conf <- funct...

ROC曲線分析をしたいが、何人のデータを集めたらいいかわからない。 こんなときどうするか？ ROC 曲線分析に必要なサンプル数の計算を R で行う準備 まずpROCパッケージをインストールする。 インストールは一回でOK。 install.packages("pROC") 毎回呼び...

マンホイットニー U 検定のサンプルサイズ計算の方法 マンホイットニーの U 検定 サンプルサイズ計算 R の”samplesize"というパッケージで、マンホイットニーの U 検定のサンプルサイズ計算ができる。 samplesize パッケージのn.wilcox.ord()を使う。 マン...