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クラスター分析とは?

クラスター分析とは何か?

そもそも、クラスターって何?

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目次

クラスターとは?

クラスターとは、グループとか塊(かたまり)の意味。

データをいくつかの塊に分けたものをクラスタと言う。

クラスター分析とは?

集めたデータをいくつかの塊に分けて、その特徴を見る方法がクラスター分析と呼ばれる。

クラスター分析にはいくつかの種類がある。

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クラスター分析の種類

英語名日本語名
Connectivity-based clustering (hierarchical clustering)階層型クラスタリング
Centroid-based clustering (k-means clustering)k平均法
Distribution-based clustering分布に基づくクラスタリング
Density-based clustering密度に基づくクラスタリング

出典:

https://en.wikipedia.org/wiki/Cluster_analysis#Algorithms

階層型クラスタリング Hierarchical Clustering

階層を作って分類する方法。データ同士の「距離」を測って、遠い・近いで分類する。

デンドログラムと呼ばれる図を描く。

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/12/Iris_dendrogram.png/220px-Iris_dendrogram.png

k 平均法 k-means Clustering

k 平均法のkは、任意の数で、1でも2でも3でもいい。

k の数だけのクラスターに分類する方法。

それぞれのクラスターの平均を使う。

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ea/K-means_convergence.gif/220px-K-means_convergence.gif

Distribution-based Clustering

Expectation-maximization (EM) アルゴリズムを使ったGaussian Mixture Modelを代表とした分布に基づくクラスタリング。

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d8/EM-Gaussian-data.svg/186px-EM-Gaussian-data.svg.png

Density-based Clustering

Density-based spatial clustering of applications with noise (DBSCAN)を代表とした密度に基づくクラスタリング。

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/05/DBSCAN-density-data.svg/200px-DBSCAN-density-data.svg.png

まとめ

クラスター分析は、いくつかのデータの塊(クラスター)に分類する分析方法。

データの特徴・構造を見出す方法で、データマイニングの一手法。

階層型クラスタリングとk平均法は特によく知られている。

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第1章臨床研究ではなぜ統計が必要なのか?計画することの重要性
  • 推定ってどんなことをしているの?
  • 臨床研究を計画するってどういうこと?
  • どうにかして標本平均を母平均に近づけられないか?
第2章:研究目的をどれだけ明確にできるのかが重要
  • データさえあれば解析でどうにかなる、という考え方は間違い
  • 何を明らかにしたいのか? という研究目的が重要
  • 研究目的は4種類に分けられる
  • 統計専門家に相談する上でも研究目的とPICOを明確化しておく
第3章:p値で結果が左右される時代は終わりました
  • アメリカ統計協会(ASA)のp値に関する声明で指摘されていること
  • そうは言っても、本当に有意差がなくてもいいの…?
  • なぜ統計専門家はp値を重要視していないのか
  • 有意差がない時に「有意な傾向があった」といってもいい?
  • 統計を放置してしまうと非常にまずい
第4章:多くの人が統計を苦手にする理由
  • 残念ながら、セミナー受講だけで統計は使えません。
  • インプットだけで統計が使えない理由
  • どうやったら統計の判断力が鍛えられるか?
  • 統計は手段なので正解がないため、最適解を判断する力が必要
第5章:統計を使えるようになるために今日から何をすれば良いか?
  • 論文を読んで統計が使えるようになるための5ステップ
第6章:統計を学ぶために重要な環境
  • 統計の3つの力をバランスよく構築する環境

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この記事を書いた人

医師、医学博士(専門は疫学および統計学)。10年以上の研究歴を有し、筆頭著者として10本の英文原著論文を執筆した実績を持つ。現在、外資系製薬企業にて15年以上にわたり、臨床開発やデータ解析、承認審査、薬価交渉戦略といった実務の最前線に従事。

「統計に悩むあなたを救いたい」をコンセプトに、ブログ「統計ER」やYouTube、SNSを通じて、医療従事者や研究者向けに「実務直結の統計ノウハウ」を配信。

学術的な厳密さと、製薬業界での高度な実務経験を融合させた独自の視点から、ブラックボックス化しない統計解析の普及を目指す。オンラインショップ「TKER SHOP」での計算ツール提供や、クラウドワークス等を通じた統計コンサルティング・解析代行(主にRを使用)も幅広く展開中。

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